目前 PokéRogue 有 4 种游戏模式：经典模式，每日挑战，无尽模式和融合无尽模式。
后两种是解锁模式。
名称类型解锁条件无尽模式模式通关经典模式融合无尽模式模式使用融合宝可梦通关经典模式微型黑洞道具通关经典模式无极汰那初始宝可梦收集所有其他初始宝可梦并在经典模式中捕捉他经典模式默认情况下，除了每日挑战外，经典模式是 PokéRogue 中唯一可用的模式。
当你开始一个新游戏时，你会进入一个初始宝可梦选择界面，在那里你可以选择任何你拥有的初始宝可梦。
你能带入的初始宝可梦的最大组合成本为 10。
经典模式是唯一可以找到地图道具的模式。
生物群系每 10 波生物群系会根据下表进行更换
每当生物群系更换时，你的所有宝可梦会被返回精灵球并恢复健康。这也会移除任何属性变化。
拥有地图道具可以让你选择下一个前往的生物群系。如果你在小镇找到地图，你可以在平原、大都会和湖泊之间选择。
生物群系图上的百分比表示该生物群系出现为你可行路线的几率。如果你有地图道具，你有该百分比的几率能够选择该生物群系。
道馆馆主和训练师道馆馆主出现的波数是随机的。你在第 20 波遇到第一个道馆馆主的几率是 50%，第 30 波的几率也是 50%。
之后，道馆馆主会在固定的波数出现，每 30 波出现一次。
四天王和冠军几乎总是来自同一个地区。你将在第 182、184、186 和 188 波面对四天王，并在第 190 波面对冠军。
关于哪个生物群系出现哪个道馆馆主，以及他们队伍中的保证成员信息，请访问生物群系页面并查找你所在的生物群系。
对战对手你的对手将在每次经典模式的相同波数挑战你。那些波数是：8、25、55、95、145 和 195。
在第一次和第二次对手对战后，你将获得一个经验分享器。
你的对手会随机选择一个主线游戏中的初始宝可梦。在第一次对战中，它会是第一阶段宝可梦。之后每次对战它都会进化，直到最终进化。从第四次对战开始，它会始终是晶耀化的。对手不能使用初始宝可梦的地区形态。
你的对手还会随机选择一只鸟类宝可梦（如波波、咕咕、傲骨燕、姆克儿、豆豆鸽、小箭雀、锹农炮虫、小锯凤或怒鸣鹰）。如果是三阶段进化宝可梦，它将在第二和第三次对战中进化。如果是两阶段进化宝可梦，它只会在第三次对战中进化。
第三只宝可梦将是一只单阶段进化且基础属性总值（BST）至少为 450 的宝可梦，但不是传说、幻兽、永恒花朵形态的花洁夫人或血月形态的月石花洁夫人。
第四只宝可梦将是一个史诗闪光的裂空座，在最后一次对战中会超级进化。
第五和第六只宝可梦将是完全进化的多阶段进化宝可梦，其基础属性总值（BST）不低于 540，且没有重复的属性。
每次对战，你的对手都会多出一只宝可梦。
Boss 宝可梦每 10 波，如果没有道馆馆主出现，会出现一个 Boss 宝可梦。
这些宝可梦在血量上有护盾，使它们更难被击倒。
在它们的血量进入最后一段之前，你无法捕捉 Boss 宝可梦。
终点生物群系第 191-200 波将在终点生物群系中进行。在这个生物群系中，每一波都会出现一个悖论宝可梦。
如果你之前捕捉过正在对战的悖论宝可梦，你可以投掷精灵球尝试捕捉第二只。
否则，终点生物群系中的宝可梦是无法捕捉的。
最终 Boss在第 200 波，你将面对经典模式的最终 Boss：无极汰那。
它的招式是无极光束、污泥炸弹、龙舞和宇宙力量。
当无极汰那的护盾到达最后一段时，它将变身为无极巨化无极汰那，并恢复满血。
变身后，它还会新增招式：极巨炮、十字毒刃、喷射火焰和回复，总共八个招式。
一旦你满足解锁无极汰那的条件，如果它在最后一段护盾时，你可以尝试捕捉它。
如果你的宝可梦超过 200 级，无极汰那对其造成的伤害将加倍。
通关奖励通关经典模式后，你将为队伍中的每个初始宝可梦获得一个丝带和一个蛋券+。
如果你的宝可梦有多种初始形态，你将获得这些初始形态的丝带和蛋券。对于未在队伍中的其他最终进化形态，不会获得额外的丝带和蛋券。
例子：
用玛力露丽通关将获得玛力露和露力丽的丝带和蛋券。
用飞腿郎通关将获得飞腿郎和铁拳郎的丝带和蛋券，但不会获得沙包郎或战舞郎的丝带和蛋券。
每日挑战每日挑战给你一个固定的三只 20 级宝可梦的队伍，通常带有特定的道具和招式。
此外，你还会从三颗经验糖果和三颗金色经验糖果开始。
该模式包含 50 层，随机选择宝可梦和训练师，包括两个道馆馆主。
第五十层在终点生物群系，对战一个传说中的宝可梦。
击败它将获得一个 10 蛋扭蛋券。每次重置只能获得一个券。
时间表每日挑战在 UTC 时间凌晨 12 点 / EST 时间晚上 8 点 / PST 时间下午 5 点重置。
无尽模式无尽模式是在至少通关一次经典模式后解锁的模式。
和经典模式一样，开始新游戏时可以选择任何你拥有的初始宝可梦。
然而在无尽模式中，初始宝可梦的最大成本提高到 15，允许你以更强大的宝可梦开始。
顾名思义，无尽模式试图永远进行下去。
然而，目前无尽模式在第 5850 波结束。
生物群系在无尽模式中，生物群系每 1-4 波更换一次。
停留在一个生物群系的波数是随机决定的。
和经典模式一样，无尽模式按照生物群系图的顺序更换生物群系
每当生物群系更换时，你的所有宝可梦会被返回精灵球并恢复健康。这也会移除任何属性变化。
无尽模式中没有地图道具。
Boss每 50 波你将面对一个随机的悖论 Boss，每 250 波你将面对无极汰那，每 1000 波你将面对无极巨化无极汰那。
每完成 50 波，你还将获得一个代币。
在经典模式中，每 10 波是一个 Boss 宝可梦。Boss 宝可梦在血量上有护盾，使它们更难被击倒。
在无尽模式中也是如此。然而，随着波数的增加，Boss 宝可梦在低于 10 波的波数上会变得更加常见。这些 Boss 宝可梦会根据其所在生物群系的 Boss 表生成。
代币代币是你每完成 50 波获得的道具。它们是永久增强敌人或削弱你的道具。下面是游戏中所有当前代币的表格。
图标代币效果最大代币数量伤害代币增加敌人伤害 5%999保护代币减少对敌人的伤害 2.5%999恢复代币每回合恢复敌人最大生命值的 3%10全愈代币每回合结束时有 10% 的几率治愈敌人的状态异常5耐久代币增加 2.5% 的几率使敌人承受你的攻击（一次击倒无法避免）10融合代币增加 1% 的几率使野生宝可梦成为融合形态10毒代币增加 10% 的几率在被对手击中时中毒5麻痹代币增加 10% 的几率在被对手击中时麻痹5睡眠代币增加 10% 的几率在被对手击中时睡眠5冻结代币增加 10% 的几率在被对手击中时冻结5灼伤代币增加 10% 的几率在被对手击中时灼伤5融合无尽模式融合无尽模式通过在队伍中使用融合宝可梦通关经典模式解锁
融合无尽模式在很大程度上与无尽模式相同，但有一些关键的区别。选择初始宝可梦后，它们会与随机宝可梦融合。
你面对的每只宝可梦都会与另一只宝可梦融合，包括 Boss 宝可梦。